Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms