Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e1P52482 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms