Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XpcP51612 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XpcP51612 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XpcP51612 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XpcP51612 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XpcP51612 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XpcP51612 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XpcP51612 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XpcP51612 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XpcP51612 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XpcP51612 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XpcP51612 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XpcP51612 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XpcP51612 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XpcP51612 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XpcP51612 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XpcP51612 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XpcP51612 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XpcP51612 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XpcP51612 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XpcP51612 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XpcP51612 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XpcP51612 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XpcP51612 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XpcP51612 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XpcP51612 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XpcP51612 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XpcP51612 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XpcP51612 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XpcP51612 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XpcP51612 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XpcP51612 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XpcP51612 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XpcP51612 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XpcP51612 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XpcP51612 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XpcP51612 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XpcP51612 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XpcP51612 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XpcP51612 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XpcP51612 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XpcP51612 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XpcP51612 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XpcP51612 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XpcP51612 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XpcP51612 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XpcP51612 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XpcP51612 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XpcP51612 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XpcP51612 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XpcP51612 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XpcP51612 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XpcP51612 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XpcP51612 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XpcP51612 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XpcP51612 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XpcP51612 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XpcP51612 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XpcP51612 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XpcP51612 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms