Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt2P50752 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms