Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TspoP50637 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TspoP50637 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TspoP50637 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TspoP50637 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TspoP50637 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TspoP50637 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TspoP50637 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TspoP50637 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TspoP50637 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TspoP50637 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TspoP50637 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TspoP50637 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TspoP50637 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TspoP50637 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TspoP50637 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TspoP50637 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TspoP50637 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TspoP50637 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TspoP50637 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TspoP50637 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TspoP50637 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TspoP50637 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TspoP50637 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms