Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FmodP50608 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FmodP50608 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FmodP50608 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FmodP50608 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FmodP50608 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FmodP50608 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FmodP50608 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FmodP50608 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FmodP50608 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FmodP50608 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FmodP50608 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FmodP50608 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FmodP50608 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FmodP50608 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FmodP50608 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FmodP50608 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FmodP50608 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FmodP50608 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FmodP50608 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FmodP50608 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms