Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf10P50592 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf10P50592 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms