Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc3P49135 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms