Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh1P48985 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms