Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnni3P48787 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms