Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prox1P48437 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prox1P48437 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prox1P48437 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prox1P48437 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms