Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcd1P48410 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms