Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VdrP48281 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VdrP48281 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VdrP48281 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VdrP48281 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VdrP48281 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VdrP48281 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VdrP48281 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VdrP48281 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VdrP48281 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VdrP48281 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VdrP48281 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VdrP48281 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VdrP48281 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VdrP48281 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VdrP48281 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VdrP48281 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VdrP48281 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VdrP48281 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VdrP48281 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VdrP48281 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VdrP48281 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VdrP48281 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VdrP48281 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VdrP48281 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VdrP48281 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VdrP48281 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms