Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brcc3P46737 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brcc3P46737 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms