Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsfP46460 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsfP46460 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsfP46460 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsfP46460 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsfP46460 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsfP46460 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsfP46460 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsfP46460 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsfP46460 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsfP46460 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsfP46460 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsfP46460 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsfP46460 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsfP46460 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsfP46460 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NsfP46460 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NsfP46460 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NsfP46460 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NsfP46460 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NsfP46460 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsfP46460 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsfP46460 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsfP46460 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsfP46460 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsfP46460 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms