Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfsf4P43488 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms