Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlx1P43345 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlx1P43345 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms