Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms