Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3caP42337 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms