Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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