Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ThpoP40226 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ThpoP40226 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms