Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timp3P39876 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms