Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptk2P34152 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms