Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2aP34056 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms