Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnar1P33896 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms