Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc3P33622 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc3P33622 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms