Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SsbP32067 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SsbP32067 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SsbP32067 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SsbP32067 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SsbP32067 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SsbP32067 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SsbP32067 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SsbP32067 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SsbP32067 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SsbP32067 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SsbP32067 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SsbP32067 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SsbP32067 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SsbP32067 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SsbP32067 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SsbP32067 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SsbP32067 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SsbP32067 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SsbP32067 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SsbP32067 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SsbP32067 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SsbP32067 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SsbP32067 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SsbP32067 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SsbP32067 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SsbP32067 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SsbP32067 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SsbP32067 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SsbP32067 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SsbP32067 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SsbP32067 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SsbP32067 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms