Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc5P32043 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms