Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OatP29758 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OatP29758 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OatP29758 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OatP29758 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OatP29758 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OatP29758 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OatP29758 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OatP29758 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OatP29758 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OatP29758 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OatP29758 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OatP29758 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OatP29758 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OatP29758 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OatP29758 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OatP29758 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OatP29758 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OatP29758 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OatP29758 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OatP29758 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OatP29758 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OatP29758 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OatP29758 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OatP29758 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OatP29758 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms