Protein–RNA interactions for Protein: P29387

Gnb4, Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb4P29387 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gnb4P29387 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms