Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp3P28862 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms