Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IppP28575 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IppP28575 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IppP28575 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IppP28575 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IppP28575 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IppP28575 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IppP28575 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IppP28575 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IppP28575 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IppP28575 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IppP28575 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IppP28575 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IppP28575 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IppP28575 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
IppP28575 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IppP28575 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IppP28575 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IppP28575 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IppP28575 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IppP28575 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IppP28575 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IppP28575 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IppP28575 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IppP28575 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IppP28575 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IppP28575 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IppP28575 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IppP28575 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms