Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LoxP28301 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LoxP28301 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LoxP28301 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LoxP28301 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LoxP28301 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LoxP28301 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LoxP28301 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LoxP28301 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LoxP28301 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LoxP28301 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms