Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms