Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms