Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms