Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf1bP25119 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf1bP25119 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms