Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms