Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms