Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn1P22387 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn1P22387 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edn1P22387 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms