Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcb1aP21447 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms