Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5bP21271 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms