Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc2P20801 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc2P20801 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms