Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prim1P20664 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Prim1P20664 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prim1P20664 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prim1P20664 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prim1P20664 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms