Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms