Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P20040 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P20040 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P20040 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P20040 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P20040 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P20040 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P20040 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P20040 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P20040 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P20040 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P20040 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P20040 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P20040 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P20040 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P20040 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P20040 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P20040 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P20040 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P20040 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms