Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms