Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18530 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18530 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18530 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18530 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18530 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18530 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18530 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18530 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18530 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18530 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18530 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18530 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18530 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms