Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb1P17919 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms