Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou4f1P17208 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou4f1P17208 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.3 ms